La estructura terciaria de las proteínas.

Haga el siguiente modelo tridimensional de papel.

  1. En una hoja de papel bond acostada (de preferencia de tamaño oficio o legal) copie el siguiente dibujo, procurando ocupar la parte más ancha por completo.

  1. Recorte alrededor de todo el dibujo.

  2. Recorte verticalmente en las líneas indicadas por la flechas gris claro y hasta llegar a la base de los triángulos superiores.

  3. Recorte las regiones indicadas con línea punteada clara (azul).

  4. Enrolle las regiones indicadas con letras sobre un lápiz o un tubo delgado, péguelas con cinta adhesiva y luego retire el lápiz deslizandolo hacia afuera.

  5. acomode las flechas numeradas (1-7) sobre la mesa una junto a la otra, inclinándolas ligeramente (unos 25 o 30o). únalas con cinta, pero no las encime, sino haga que queden como una cerca de jardín con varas inclinadas), algo así como: //////

  6. Levante sus flechas de la mesa y ahora ciérrelas formando un cilindro, al ubicar la flecha 1 junto a la 7, de manera que las regiones en forma de tubo que formó en el paso 5, queden en la parte externa de su barril. Mantenga la misma inclinación entre las flechas 1 y 7 que entre todas las demás y únalas también con cinta.

  7. USTED ACABA DE FORMAR UN ESQUEMA TRIDIMENSIONAL DEL LLAMADO BARRIL TIM.

Investigue la estructura de la TIM (triosa fosfato isomerasa), compárela con su dibujo y conteste las siguientes preguntas.

  1. ¿ Porqué esta estructura recibe el nombre de barril ?

  2. ¿ Qué representan la regiones en forma de tubo ?

  3. ¿ Qué representan las partes en formas de flechas ?

  4. ¿ Qué representan los listones angostos que conectan todas esta regiones ?

  5. Aprovechando sus conocimientos de estructura secundaria ubique las partes de su modelo en que quedaría los grupos R de los aminoácidos que forman esta estructura.

  6. ¿ Encontraríamos cadenas laterales de aminoácidos atrapadas en el interior del barril ?

  7. ¿ Habría cadenas laterales en las bordes superiores e inferiores del barril ?

  8. ¿ Habrá grupos R de aminoácido que se encuentren en los regiones intermedias entre las zonas tubulares y las flechas planas ?

  9. Si la respuesta fue si, ¿ pertenecen estos grupos a aminoácidos que forman parte de la zona tubular , de la flecha plana o de ambas ?

  10. ¿ Qué tipo de aminoácidos piensa que se encontrarán predominantemente en cada una de las tres regiones anteriormente descritas ?