La estructura terciaria de las proteínas.
Haga el siguiente modelo tridimensional de papel.
En una hoja de papel bond acostada (de preferencia de tamaño oficio o legal) copie el siguiente dibujo, procurando ocupar la parte más ancha por completo.
Recorte alrededor de todo el dibujo.
Recorte verticalmente en las líneas indicadas por la flechas gris claro y hasta llegar a la base de los triángulos superiores.
Recorte las regiones indicadas con línea punteada clara (azul).
Enrolle las regiones indicadas con letras sobre un lápiz o un tubo delgado, péguelas con cinta adhesiva y luego retire el lápiz deslizandolo hacia afuera.
acomode las flechas numeradas (1-7) sobre la mesa una junto a la otra, inclinándolas ligeramente (unos 25 o 30o). únalas con cinta, pero no las encime, sino haga que queden como una cerca de jardín con varas inclinadas), algo así como: //////
Levante sus flechas de la mesa y ahora ciérrelas formando un cilindro, al ubicar la flecha 1 junto a la 7, de manera que las regiones en forma de tubo que formó en el paso 5, queden en la parte externa de su barril. Mantenga la misma inclinación entre las flechas 1 y 7 que entre todas las demás y únalas también con cinta.
USTED ACABA DE FORMAR UN ESQUEMA TRIDIMENSIONAL DEL LLAMADO BARRIL TIM.
Investigue la estructura de la TIM (triosa fosfato isomerasa), compárela con su dibujo y conteste las siguientes preguntas.
¿ Porqué esta estructura recibe el nombre de barril ?
¿ Qué representan la regiones en forma de tubo ?
¿ Qué representan las partes en formas de flechas ?
¿ Qué representan los listones angostos que conectan todas esta regiones ?
Aprovechando sus conocimientos de estructura secundaria ubique las partes de su modelo en que quedaría los grupos R de los aminoácidos que forman esta estructura.
¿ Encontraríamos cadenas laterales de aminoácidos atrapadas en el interior del barril ?
¿ Habría cadenas laterales en las bordes superiores e inferiores del barril ?
¿ Habrá grupos R de aminoácido que se encuentren en los regiones intermedias entre las zonas tubulares y las flechas planas ?
Si la respuesta fue si, ¿ pertenecen estos grupos a aminoácidos que forman parte de la zona tubular , de la flecha plana o de ambas ?
¿ Qué tipo de aminoácidos piensa que se encontrarán predominantemente en cada una de las tres regiones anteriormente descritas ?