ALSO:
cd “~”
mkdir “mypdb”
cd “mypdb”
menu pdbtool on
Opens with:
Extensions -> PDB query
1ude
Click→
→choose “mypdb” folder, click OK
when done,
close the window
VMD cuenta con un soporte para descargar archivos del Protein Data Bank por código de acceso.
Desafortunadamente, las restricciones de seguridad de los SO modernos requieren que esta opción se configure y se habilite después de instalar VMD.
No se complique, use su navegador, descargue el archivo mediante el navegador y lo abriremos desde el disco.
El formato puede ser extensión pdb o cif
ambos son reconocidos por VMD