Varían en la longitud de la cadena de poliisopreno, las más abundantes son Q9 y Q10.
Las quinonas mitocondriales son lípidos terpénicos con un anillo de quinona que les confiere propiedades redox.
Poseen cadenas hidrocarbonadas insaturadas y ramificadas típicas de los terpenos y su longitud varia.
En la mitocondria de células eucariontes las quinonas más abundantes son ubiquinona 10 y ubiquinona 9.
Pueden aceptar un electrón y convertirse en un radical seminiquinona muy reactivo o aceptar 2 e– y convertirse en ubiquinol.
Pueden estar unidos a proteína o encontrarse disueltos en la membrana, llevando electrones desde los complejos I y II hasta el III.