La mitocondria es fundamental para la mayoría de las células Eucariontes.
Debido a ello existen muchos compuestos naturales y sintéticos que están dirigidos contra la cadena respiratoria.
Algunos interfieren bloqueando el flujo de electrones en algún punto, como la Rotenona o la antimicina A.
Otros bloquean la síntesis de ATP en la ATP sintasa.
Otros abaten el gradiente de protones, lo que no impide el flujo de electrones, pero sí la síntesis de ATP. Estos últimos se conocen por ello como desacoplantes.