+ ATP
Sitio sintético apolar justo del tamaño de la valina
Leu
val
Ala
+ ATP
+ ATP
1. Paso de activación del aminoácido
Leu no es activada
Ala-AMP
Val-AMP
Ala, val, o gly si son activados
la val-tRNA sintetasa usa discriminación por polaridad y tamaño.
Cada aminoacil-tRNA sintetasa usa una estrategia propia para asegurar seleccionar el aminoácido que le corresponde, pues esto depende de la química de dicho aminoácido.
Por ejemplo, la aminoacil-tRNA sintetasa de Valina, tiene dos sitios activos.
Primero, la valina es activada en un sitio activo apolar y de tamaño justo para la valina. Así, isoluecina o isoleucina no caben y no se activan. Sin embargo, alanina o glicina son más pequeños, por lo que pueden colarse y quedar activados.