Las bases nitrogenadas pueden ser de dos tipos
Para evitar confusiones en la numeración de los carbonos de las bases y de la azúcar, los número de los carbonos de la pentosa se escriben con apóstrofe (1', 2', 3', 4' y 5')
Las Bases nitrogenadas son derivados de dos compuestos patrón:
1. El núcleo de Purina, dos anillos fusionados de 6 y 5 miembros hetercíclicos, aromáticos y con 3 nitrógenos.
2. El núcleo de Pirimidina, una anillo heterocíclico de 6 miembros, aromático y con 2 nitrógenos.
Note que para evitar la confusión en la numeración y para evitar tener que redefinir la numeración para cada caso, los carbonos de la azúcar reciben números con apóstrofe: 1', 2' ,3' 4' y 5'