El mecanismo es semejante al de la HEXOCINASA, El alcohol del carbono 1 se desprotona por CATALISIS ACIDO-BASE GENERAL y un ataque nucleofílico SN2 desplaza al fosfato-γ del ATP
La enzima tiene un sitio ALOSTÉRICO al que se unen ADP, AMP, ATP Y FRUCTOSA-2,6-BISFOSFATO.
Pero al unirse ATP la enzima se inhibe, mientras que los demás la activan. Note que ATP en el sitio activo favorece la reacción y en el alostérico la impide. Esto se conoce como inhibición por exceso de sustrato y evita la sobreproducción glucolítica de ATP