Por cada NADH oxidado se transfieren 2 e– y 2 H+ a la quinona, formando un quinol que se difunde a la membrana.
En forma paralela, 4 protones son translocados a través de la membrana acidificando el espacio intermembranal y alcalinizando la matriz mitocondrial.
Belevich et al. Mol Microbiol (2011) 82: 1086-95
o matriz mitocondrial
Cada NADH debe donar 2 electrones que terminan en el ubiquinol. Sin embargo los transportadores intermedios son centros 2Fe-2S y 4Fe-4S de manera que los electrones tienes que separarse y fluir de 1 en 1.
Asociado a la transferencia de electrones, se da la translocación de protones.
Ambos procesos están fuertemente acoplados, si se impide la translocación la enzima se queda reducida, pero no continua aceptando más sustrato