Cada subunidad pasa en secuencia por cada una de tres conformaciones:
A) Conformación de baja afinidad, el sitio activo casi no se ocupa pues su afinidad por ADP es baja.
B) Afinidad intermedia. El sitio activo se ocupa con ADP·Mg2+ y fosfato.
C) Alta afinidad. El sitio tiene ATP y está tan fuertemente unido que no se libera, de hecho en el bolsillo la vía de acceso está obstruída por completo.
El cambio conformacional es promovido por la rotación de la subunidad γ.