Para la terminación, los replisomas deben encontrar y reconocer a los sitios llamados terA, terB, etc.
Al igual que oriC los sitios ter son sitios en el DNA con secuencias de bases características, que son reconocidos por proteínas específicas de unión a DNA y que luego interactúan con el replisoma.
Cuando esto ocurre, el replisoma hace pausas y esto da tiempo a que la otra horquilla alcance este punto del cromosoma.