El azúcar y el apareamiento de las bases da lugar a una espiral DOBLE, llamada "doble hélice B del DNA"
La conformación del esqueleto de azúcar fosfato que sostiene a las bases es repetitiva y el anillo de azúcar se mantiene en conformación C2'–endo.
El resultado es una espiral que mantiene a las bases apiladas de manera compacta, mejorando la estabilidad de la estructura, pues esconde la regiones apolares de las bases del contacto con el solvente, pero expone las partes polares permitiendo la generación de dos surcos, llamados el surco mayor y surco menor.
Estos surcos difieren en tamaño, por que la mayor parte de los átomos de la base se orientan hacia un surco, requiriendo una mayor separación.