EL fraccionamiento por precipitación consiste en añadir algo que insolubilice a la proteína.
La proteína precipitada puede recuperarse por sedimentación, o mejor aún, por centrifugación.
Este método generalmente elimina ciertas sales, pigmentos, metabolitos pequeños y otros contaminantes.
También, elimina algunas proteínas contaminantes,
esas que no se agregan en las condiciones usadas,
para precipitar a la proteína de interés.