Escalera de secuenciación “MALDI linear DE-TOF-MS” del fragmento 18-39 de la hormona adrenocorticotropica (ACTH) fragment 18-39 mediante la técnica de digestión con carboxipepetidasa Y. Potencial de aceleración 25 kV, pulso de demora de 150 ns a 1.30 kV, 50 pulsos laser promediados en cada espectro. Tomado de John J. Lennon. U. of Washington (http://www.abrf.org/ABRFNews/1997/June1997/jun97lennon.html)
Figura que ilustra como se forman los fragmentos de la proteína, por ruptura de enlaces a lo largo de la cadena de aminoácidos.
Secuencia primaria mediante MS
Aquí una escalera de secuenciación clásica.
Por diferencia de masas entre dos fragmentos Y consecutivos, se puede deducir cual resto de aminoácido estaba presente.
Luego, la secuencia se construye usando estas diferencias, para cada péptido.
Finalmente, se ensambla el rompecabezas con todos los péptidos que formaban la proteína y se obtiene su secuencia de aminoácidos.
(Tomado de John J. Lennon. U. of Washington /www.abrf.org/ABRFNews/1997/June1997/jun97lennon.html)