Damaged DNA
La enzima de E. coli DNA polimerasa I tiene además un tercer sitio activo, capaz de cortar en la dirección es decir por delante de ella, eliminando una hebra del DNA de doble cadena.
La DNA polimerasa III es más procesiva y, por tanto, más rápida. Pero cuando llega a un sitio donde el DNA ya es doble cadena, deja de copiar, se disocia y queda un enlace fosfodiester sin formar (una melladura o nick, en Inglés).
La DNA polimerasa I que detacta una melladura en un sitio con doble cadena, puede sondear la calidad del DNA por delante, si encuentra defectos puede cortarlo y, luego, sintetizar de nuevo el fragmento abierto, eliminando el defecto.