En las bacterias mucho del RNA se usa sin modificarse, pero el rRNA y el tRNA se sintetizan como transcritos muy grandes que deben contarse, rasurarse, modificarse y, en el caso del tRNA añadirse un extremo –CCA.3'OH
Muchos de estos RNA contiene bases modificadas características de estos ácidos nucléicos.
Enzimas y/o Ribozimas especializadas hacen estas modificaciones