Debido a que los pares GC tiene 3 puentes de H y los pares AT sólo 2, la temperatura de fusión de la doble hélice es proporcional al contenido de GC del DNA en estudio.
Como vemos en la imagen, hay una muy buena correlación entre el contenido de pares G≣C y la temperatura de fusión del DNA de doble hélice.
Se ha observado que los organismos hipertermófilos tienen genomas con mayor contenido de pares G≣C.